日本水军使用的船只大致上三种常规型号和一种特殊型号。常规的依大小排序是安宅船、关船、小早船。三种船都是单桅，远洋时使用帆，近战则使用橹，船体分上中底三部分，底部在吃水线以下。另外还有一种非常规型号，称为铁甲船，但是太重，既不能出远海，又因为日本产铁量不足，造得也很少，暂时可以不提。
那么其他三种船里首先要说的就是安宅船，这种船体积大而坚固，使用“龟骨”，但比同时代京华系之外的明船都脆弱得多，与京华的武装运输舰相比就更不必提了。
该船中央后方设警楼，分三层，配小橹百六十，大橹八十。武器为大筒与铁炮(火炮和火枪)，是正规海军的核心力量，水军布阵时的核心所在，两千石(指载重衡量单位，不同于大明的多少多少料)以上的大船可归入此类。但要注意的是，即便是日本最大规格的安宅船，也还不如京华的武装运输舰大。
其次是关船，这是一款中型战船，设计思想是在兼顾防御力的基础上提高机动性，两舷在八十挺橹到四十挺橹之间。武器也是大筒与铁炮，这种船是当前日本水军的主战力量。
然后是小早船，这是一款小型船，设计思想是放弃防御力，尽可能大的提高机动性。两舷在四十挺橹之下，在正规海军中主要负责侦察和传报。但因其轻巧灵便，效费比相对较高，而技术含量低，故成为海贼们的主流舰只，常常集群使用。
小早船又可以分为铁炮船、长柄船、奇船、物见船、番船、兵粮船等。人员的配备以八百石船为例子，一般配备橹百只，则需要水手百人，船头舵手五人，火枪兵百人左右，战斗人员占据总人数的一半。如果以风帆为动力，则所需水手可大大减少，则搭乘百人的铁炮队。
从以上日本水军的船只就可以看出，小早船单纯只能作战，基本不具备运载能力；关船可以作战也可以运载，但考虑到海船需要储备本船所需的物资来保证自持力，故关船的运载量也比较有限；安宅船如果不以作战为主要出航目的，则运载量相对要大一些，但这种船跑得慢，又相应地浪费了运载吨位。
由于日本水军习惯了使用较小型的船只，而且他们目前还没有“巨舰大炮”主义思想，故认为全部换装京华制式的武装运输舰比较不划算，所以就提出了两款定制战舰的计划，希望京华能专门为其设计建造一批。
按照丰臣秀长提出的计划，丰臣家首先需要以安宅船大小为大致标准，请京华为其设计建造一批新式安宅船，主要的要求是在不降低其防御力和运载量的基础上明显提高航速。
第二个定制战舰当然就是新式关船了，要求则与新式安宅船相反，是在保持其航速的基础上强化防御力，最好还能提高一些运载量。
理论上而言，如果造舰技术达到一定的水准，这三个标准之间无非就是你强我就弱，你弱我就强，不存在维持一个或两个维度的前提下还能提高另一个维度。但问题是，日本的造舰技术此时颇为落后，安宅船和关船的技术水平都还有很大的提升空间，所以实际上京华是有能力为它们进行技术升级的。
这种技术升级甚至不需要京华花费太大的工夫，因为此刻大明除了京华之外，本身的造舰水平就几乎能够满足丰臣家提出的要求——当然这是指大明正规水师的军舰水平，而非指民间造船厂的产品，那个就太复杂，而且有些良莠不齐了。
事实上，即便不算京华或者海贸同盟，明朝水师的实力在此时的世界上也不算弱，以今年为标准(1590年)，综合作战能力大概可以列在前五以内。设计和造舰实力也不差，仅嘉靖到万历年间，只江浙一带，战船的型号就达到了二十一种之多，如果加上福建和两广，型号更是繁多。
从全球角度来看，随着火器的大量应用，海军战术也随之发生了重大改变，早些年俞大猷就适时提出过一个海战基本原则：“海战不过是以大船胜小船，以大铳胜小铳；以多船胜寡船，以多铳胜寡铳。”
由此可见，大明的海战很早就进入了近代模式。在嘉靖年间，明军的战船就已经有一半以上的战斗人员都使用火器，而到了万历年间，比例更是达到了七成以上，在全世界范围内都算是火器化程度非常高的了。
至于京华的两洋舰队全部火器化，那是另一回事，而且也是到了刺刀问世才达到的。原本京华两洋舰队就不推崇接弦登舰作战，但早年间考虑到这种情况可能还是偶尔会有，因此也配备过雁翎刀。后来有了刺刀，单独的雁翎刀就被取消了，所有舰队配备的火枪都是刺刀款。
此时大明水师的装备主要以福船为主，这是诞生于福建沿海的一种船型的统称，其底尖上阔，首尖尾宽两头翘。建材主要为福建的松、杉、樟、楠木，共有六种型号。
海战用的福船，特指一号和二号。按曾在1560年取得数次大胜的戚继光所言：“福船高大如城，非人力可驱，全仗风势，倭船自来矮小如我小苍船，故福船乘风下压，如车碾螳螂。斗船力而不在斗人力。”其海战观点与俞大猷基本一致，当然与高务实也基本一致。
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