他又下令将这个团编入其亲信王安澜统率的第六镇，又遭强烈反对，被迫收回成命。
最后又设计想把该团改为军官学校，也没能成功。
民国成立后，南北方不打仗了，都开始裁撤军队。原兵站所辖六个大队，共千余人，黎元洪下令将其解散。
张振武则把这支队伍改编成军务司护卫队，又成了他亲手掌握的一支部队。这样的在黎元洪身边拥兵自重，让黎元洪如何能泰然处之。
更何况，张振武对黎元洪的施政有诸多不满，还经常把“鄂政不良，我等当再度革命”也挂在嘴上。
在两个人之间，还有一件怨恨很深之事。南北议和期间，为了做打的准备，张振武曾带巨款去沪购置军火。
湖北驻沪代表杨玉如电告黎元洪，说张振武“耗费公款，械不合用”。
黎元洪派人去查他的账目，并电请沪都督陈其美监视他的活动。
张振武一怒之下返鄂，当面质问黎元洪：“你凭什么资格查我的帐？”
黎元洪实行军民分治，将武昌起义有功人员，警视厅长顾庆云排挤去职。张振武非常气愤，上书黎元洪严词诘责，使黎元洪觉得张振武是处处和自己作对。
群英会事件后，黎元洪改军务部为军务司，军务部原正副部长孙武、蒋翊武和张振武同时被解职。孙、蒋都消极隐退，只有张振武不干。不甘为军事顾问，强烈要求留任，黎更加对张不满。
黎元洪一开始是想把张振武调出湖北。
请袁世凯帮忙，调张振武为“东三省边防使”，让张振武带着自己的人马，走得远远的。
袁世凯开始一口答应。
但革命党人终究是外人，袁世凯怎能让革命党的人马在他的身后驻扎。便借口东北大局已定，南军不服北方的水土等理由推托。
黎元洪和袁世凯说了实话，请袁世凯解决困难。
恰巧袁世凯就任大总统之后，一直想打压南方革命派的军事力量，因此在对于张振武的态度上和黎元洪达成一致。在袁世凯的亲信、参谋次长陈宦的策划下，决定对张振武等人施行调虎离山之计。
于是袁世凯以共商建国大计的名义，邀请孙武、蒋翊武、刘公、张振武等民国元勋十六人入京就职。
张振武信以为真，当他踌躇满志的和孙武等人赶到京城时，没想到袁世凯为“三武”安排的全是总统府军事顾问虚衔。
孙武和蒋翊武没说什么，张振武大怒，当众指责：“我湖北人只会做顾问官耶？”
他找袁世凯要求，安排实职。袁世凯没有办法，只好又封他为蒙古屯垦使加以敷衍。
张振武又信以为真，对这个职务很满意，遂和袁世凯落实经费和人员编制。
袁世凯又借口经费困难，目前无法筹措。
张振武一怒之下返回湖北。自立门户，在汉口设立屯垦事务所。要求黎元洪每月提供经费一千元，准备召兵一镇，去蒙古屯边。
黎元洪在裁撤军队，而张振武却在这里招兵买马，这不是和他对着干吗？谁知道张振武招的兵马干什么用？如果是对自己搞兵变，搞什么“二次革命”怎么办？
还要自己给提供经费，不是明摆着欺负人吗。我给你钱，让你招兵买马革我的命，谁是傻瓜吗？
一山不容二虎，有张振武无自己，有自己无张振武。这个时候的黎元洪，应该是已动杀机。
但是，袁世凯当起了好人，特意派出湖北籍的参议员刘成禺、郑万瞻回武昌进行调解。
刘成禺等人属于议会中共和党的参议员，张振武属于共和党中的民社派，他们出面张振武也不能不给面子。
在各方努力下，张振武和黎元洪等武昌地方军政大员至少在表面上恢复了和气。
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